Oprócz procedury narodowej rejestracji leków, w której każdy kraj indywidualnie ocenia dokumentację, celem zmniejszenia obciążeń związanych z z rejestracją w kilku krajach, w ramach Wspólnoty opracowano procedury równoległej oceny przez kilka agencji oraz procedury zakładające uznanie oceny wykonanej przez jeden kraj tzw. państwo referencyjne (reference memeber state RMS) w pozostałych krajach. W praktyce nadal jest to ocena przez każdy z krajów, z tym, że odbywa się ona w ramach jednej wspólnej procedury wszczynanej i koordynowanej przez RMS. Wobec znacznego skomplikowania procedur, wymagań, badań itd. pojawiła się w ostatnich kilkudzisięciu latach (początkowo w USA potem w Europie) osobna profesja - regulatory affairs.

Na dzień dzisiejszy wyróżniamy tu dwie procedury:

- starszą procedurę wzajemnego uznania MRP oraz

- nowszą procedurę zdecentralizowaną DCP.

Procedura MRP trwa dotyczy produktów, które posiadają już pozwolenie w jednym z krajów EU i rejestracja produktu leczniczego odbywa się w kolejnych krajach na zasadzie uwag zgłaszanych do oceny wykonanej przez ten kraj (RMS). W praktyce oprócz oceny wykonanej przez RMS ocenie podlega w nowych krajach tak naprawdę cała dokumentacja.

Druga z procedur - procedura zdecentralizowana DCP jest procedurą nowszą. Dotyczy sytuacji gdy produkt leczniczy nie posiada jeszcze pozwolenia w EU. W takiej sytuacji jedno z Państw, które mają zostać objęte procedurą Przyjmuje rolę RMS i jest odpowiedzialne za główną ocenę i koordynację całej procedury, natomiast pozostałe państwa odnoszą się do wykonanej przez ten kraj oceny. Kraj mający pełnić rolę RMS musi wyrazić zgodę na poprowadzenie i koordynację procedury, co wiąże się z przyznaniem tzw. slot dla wnioskodawcy.

Końcową fazą obu procedur jest etap narodowy polegający na ocenie tłumaczeń narodowych druków uzgodnionych w trakcie procedury.

W przypadku obu procedur konieczna jest końcowa zgoda wszystkich krajów by zakończyć procedurę. W wypadku braku takiej zgody w terminie procedury (90 dni dla MRP i 210 dni dla DCP) wszczynane są procedury arbitrażowe na poziomie grupy CMD oraz na dalszym etapie na poziomie Europejskiej Agencji Leków. Obecnie procedura MRP traci na znaczeniu i dotyczy raczej starszych leków, natomiast zwiększa się liczba procedur prowadzonych w systemie DCP.

Ostatnią z procedur europejskich dotyczących rejestracji produktu leczniczego w całej EU jest procedura centralna ze względu na koszty i wymagania dotycząca przede wszystkim produktów innowacyjnych.